Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFZ3

NLGN4Y, Neuroligin-4, Y-linked, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4YQ8NFZ3 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLGN4YQ8NFZ3 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLGN4YQ8NFZ3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLGN4YQ8NFZ3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NLGN4YQ8NFZ3 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLGN4YQ8NFZ3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLGN4YQ8NFZ3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLGN4YQ8NFZ3 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLGN4YQ8NFZ3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NLGN4YQ8NFZ3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLGN4YQ8NFZ3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NLGN4YQ8NFZ3 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLGN4YQ8NFZ3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NLGN4YQ8NFZ3 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLGN4YQ8NFZ3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLGN4YQ8NFZ3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NLGN4YQ8NFZ3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLGN4YQ8NFZ3 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NLGN4YQ8NFZ3 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLGN4YQ8NFZ3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLGN4YQ8NFZ3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLGN4YQ8NFZ3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NLGN4YQ8NFZ3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
NLGN4YQ8NFZ3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NLGN4YQ8NFZ3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
NLGN4YQ8NFZ3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms