Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEE8

TTC16, Tetratricopeptide repeat protein 16, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC16Q8NEE8 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTC16Q8NEE8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC16Q8NEE8 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC16Q8NEE8 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC16Q8NEE8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC16Q8NEE8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTC16Q8NEE8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTC16Q8NEE8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC16Q8NEE8 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC16Q8NEE8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC16Q8NEE8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC16Q8NEE8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC16Q8NEE8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC16Q8NEE8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TTC16Q8NEE8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC16Q8NEE8 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC16Q8NEE8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC16Q8NEE8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC16Q8NEE8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC16Q8NEE8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TTC16Q8NEE8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC16Q8NEE8 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC16Q8NEE8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC16Q8NEE8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TTC16Q8NEE8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC16Q8NEE8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC16Q8NEE8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC16Q8NEE8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TTC16Q8NEE8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC16Q8NEE8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC16Q8NEE8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC16Q8NEE8 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC16Q8NEE8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC16Q8NEE8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC16Q8NEE8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC16Q8NEE8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TTC16Q8NEE8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC16Q8NEE8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC16Q8NEE8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC16Q8NEE8 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC16Q8NEE8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TTC16Q8NEE8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC16Q8NEE8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC16Q8NEE8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC16Q8NEE8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC16Q8NEE8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC16Q8NEE8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC16Q8NEE8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC16Q8NEE8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TTC16Q8NEE8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC16Q8NEE8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC16Q8NEE8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TTC16Q8NEE8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TTC16Q8NEE8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
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