Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND07

BBOF1, Basal body-orientation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOF1Q8ND07 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BBOF1Q8ND07 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BBOF1Q8ND07 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
BBOF1Q8ND07 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms