Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS7

SLC44A5, Choline transporter-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A5Q8NCS7 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SLC44A5Q8NCS7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC44A5Q8NCS7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SLC44A5Q8NCS7 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
SLC44A5Q8NCS7 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC44A5Q8NCS7 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC44A5Q8NCS7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC44A5Q8NCS7 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SLC44A5Q8NCS7 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC44A5Q8NCS7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SLC44A5Q8NCS7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC44A5Q8NCS7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC44A5Q8NCS7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC44A5Q8NCS7 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC44A5Q8NCS7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC44A5Q8NCS7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC44A5Q8NCS7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC44A5Q8NCS7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC44A5Q8NCS7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SLC44A5Q8NCS7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC44A5Q8NCS7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC44A5Q8NCS7 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC44A5Q8NCS7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC44A5Q8NCS7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC44A5Q8NCS7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC44A5Q8NCS7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC44A5Q8NCS7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC44A5Q8NCS7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SLC44A5Q8NCS7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC44A5Q8NCS7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC44A5Q8NCS7 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC44A5Q8NCS7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC44A5Q8NCS7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC44A5Q8NCS7 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC44A5Q8NCS7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC44A5Q8NCS7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC44A5Q8NCS7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SLC44A5Q8NCS7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC44A5Q8NCS7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC44A5Q8NCS7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC44A5Q8NCS7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SLC44A5Q8NCS7 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SLC44A5Q8NCS7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SLC44A5Q8NCS7 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms