Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBT2

SPC24, Kinetochore protein Spc24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC24Q8NBT2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPC24Q8NBT2 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SPC24Q8NBT2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPC24Q8NBT2 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPC24Q8NBT2 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPC24Q8NBT2 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPC24Q8NBT2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
SPC24Q8NBT2 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPC24Q8NBT2 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPC24Q8NBT2 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPC24Q8NBT2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPC24Q8NBT2 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPC24Q8NBT2 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPC24Q8NBT2 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
SPC24Q8NBT2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPC24Q8NBT2 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPC24Q8NBT2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPC24Q8NBT2 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPC24Q8NBT2 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPC24Q8NBT2 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPC24Q8NBT2 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPC24Q8NBT2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPC24Q8NBT2 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPC24Q8NBT2 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPC24Q8NBT2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPC24Q8NBT2 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPC24Q8NBT2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPC24Q8NBT2 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPC24Q8NBT2 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPC24Q8NBT2 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPC24Q8NBT2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPC24Q8NBT2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPC24Q8NBT2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
SPC24Q8NBT2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPC24Q8NBT2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPC24Q8NBT2 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPC24Q8NBT2 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPC24Q8NBT2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPC24Q8NBT2 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPC24Q8NBT2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPC24Q8NBT2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPC24Q8NBT2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPC24Q8NBT2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPC24Q8NBT2 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPC24Q8NBT2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPC24Q8NBT2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPC24Q8NBT2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPC24Q8NBT2 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPC24Q8NBT2 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPC24Q8NBT2 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
SPC24Q8NBT2 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
SPC24Q8NBT2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPC24Q8NBT2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPC24Q8NBT2 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPC24Q8NBT2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SPC24Q8NBT2 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms