Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9P6

C9orf163, Uncharacterized protein C9orf163, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf163Q8N9P6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
C9orf163Q8N9P6 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf163Q8N9P6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 288.4 ms