Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CRACR2BQ8N4Y2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
CRACR2BQ8N4Y2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CRACR2BQ8N4Y2 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CRACR2BQ8N4Y2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CRACR2BQ8N4Y2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CRACR2BQ8N4Y2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CRACR2BQ8N4Y2 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CRACR2BQ8N4Y2 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CRACR2BQ8N4Y2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CRACR2BQ8N4Y2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CRACR2BQ8N4Y2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CRACR2BQ8N4Y2 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CRACR2BQ8N4Y2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CRACR2BQ8N4Y2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CRACR2BQ8N4Y2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CRACR2BQ8N4Y2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CRACR2BQ8N4Y2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CRACR2BQ8N4Y2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
CRACR2BQ8N4Y2 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CRACR2BQ8N4Y2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
CRACR2BQ8N4Y2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
CRACR2BQ8N4Y2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CRACR2BQ8N4Y2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CRACR2BQ8N4Y2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CRACR2BQ8N4Y2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CRACR2BQ8N4Y2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CRACR2BQ8N4Y2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CRACR2BQ8N4Y2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CRACR2BQ8N4Y2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CRACR2BQ8N4Y2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CRACR2BQ8N4Y2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CRACR2BQ8N4Y2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CRACR2BQ8N4Y2 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CRACR2BQ8N4Y2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CRACR2BQ8N4Y2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CRACR2BQ8N4Y2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CRACR2BQ8N4Y2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CRACR2BQ8N4Y2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CRACR2BQ8N4Y2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CRACR2BQ8N4Y2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRACR2BQ8N4Y2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRACR2BQ8N4Y2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRACR2BQ8N4Y2 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRACR2BQ8N4Y2 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRACR2BQ8N4Y2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CRACR2BQ8N4Y2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CRACR2BQ8N4Y2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CRACR2BQ8N4Y2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CRACR2BQ8N4Y2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CRACR2BQ8N4Y2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CRACR2BQ8N4Y2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CRACR2BQ8N4Y2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CRACR2BQ8N4Y2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CRACR2BQ8N4Y2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CRACR2BQ8N4Y2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CRACR2BQ8N4Y2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CRACR2BQ8N4Y2 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CRACR2BQ8N4Y2 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CRACR2BQ8N4Y2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms