Protein–RNA interactions for Protein: Q8N431

RASGEF1C, Ras-GEF domain-containing family member 1C, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1CQ8N431 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RASGEF1CQ8N431 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RASGEF1CQ8N431 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RASGEF1CQ8N431 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RASGEF1CQ8N431 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RASGEF1CQ8N431 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RASGEF1CQ8N431 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RASGEF1CQ8N431 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RASGEF1CQ8N431 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RASGEF1CQ8N431 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RASGEF1CQ8N431 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RASGEF1CQ8N431 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RASGEF1CQ8N431 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RASGEF1CQ8N431 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RASGEF1CQ8N431 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RASGEF1CQ8N431 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RASGEF1CQ8N431 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RASGEF1CQ8N431 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RASGEF1CQ8N431 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RASGEF1CQ8N431 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RASGEF1CQ8N431 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RASGEF1CQ8N431 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms