Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2H9

PELI3, E3 ubiquitin-protein ligase pellino homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PELI3Q8N2H9 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PELI3Q8N2H9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PELI3Q8N2H9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PELI3Q8N2H9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PELI3Q8N2H9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PELI3Q8N2H9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PELI3Q8N2H9 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PELI3Q8N2H9 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PELI3Q8N2H9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PELI3Q8N2H9 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PELI3Q8N2H9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PELI3Q8N2H9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.8 ms