Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1W1

ARHGEF28, Rho guanine nucleotide exchange factor 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF28Q8N1W1 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
ARHGEF28Q8N1W1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
ARHGEF28Q8N1W1 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ARHGEF28Q8N1W1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
ARHGEF28Q8N1W1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
ARHGEF28Q8N1W1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ARHGEF28Q8N1W1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
ARHGEF28Q8N1W1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ARHGEF28Q8N1W1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ARHGEF28Q8N1W1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ARHGEF28Q8N1W1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
ARHGEF28Q8N1W1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
ARHGEF28Q8N1W1 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ARHGEF28Q8N1W1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ARHGEF28Q8N1W1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
ARHGEF28Q8N1W1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
ARHGEF28Q8N1W1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
ARHGEF28Q8N1W1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
ARHGEF28Q8N1W1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ARHGEF28Q8N1W1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ARHGEF28Q8N1W1 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ARHGEF28Q8N1W1 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ARHGEF28Q8N1W1 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ARHGEF28Q8N1W1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
ARHGEF28Q8N1W1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ARHGEF28Q8N1W1 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.87■■■■□ 3.01
ARHGEF28Q8N1W1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ARHGEF28Q8N1W1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ARHGEF28Q8N1W1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ARHGEF28Q8N1W1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ARHGEF28Q8N1W1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
ARHGEF28Q8N1W1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ARHGEF28Q8N1W1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ARHGEF28Q8N1W1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
ARHGEF28Q8N1W1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ARHGEF28Q8N1W1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
ARHGEF28Q8N1W1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ARHGEF28Q8N1W1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ARHGEF28Q8N1W1 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
ARHGEF28Q8N1W1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
ARHGEF28Q8N1W1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ARHGEF28Q8N1W1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ARHGEF28Q8N1W1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
ARHGEF28Q8N1W1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
ARHGEF28Q8N1W1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
ARHGEF28Q8N1W1 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
ARHGEF28Q8N1W1 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.82■■■■□ 3.01
ARHGEF28Q8N1W1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.82■■■■□ 3
ARHGEF28Q8N1W1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC33.82■■■■□ 3
ARHGEF28Q8N1W1 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.82■■■■□ 3
ARHGEF28Q8N1W1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
ARHGEF28Q8N1W1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
ARHGEF28Q8N1W1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
ARHGEF28Q8N1W1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
ARHGEF28Q8N1W1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
ARHGEF28Q8N1W1 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
ARHGEF28Q8N1W1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
ARHGEF28Q8N1W1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
ARHGEF28Q8N1W1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
ARHGEF28Q8N1W1 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
ARHGEF28Q8N1W1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
ARHGEF28Q8N1W1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ARHGEF28Q8N1W1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
ARHGEF28Q8N1W1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ARHGEF28Q8N1W1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
ARHGEF28Q8N1W1 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
ARHGEF28Q8N1W1 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC33.78■■■■□ 3
ARHGEF28Q8N1W1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
ARHGEF28Q8N1W1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
ARHGEF28Q8N1W1 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
ARHGEF28Q8N1W1 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
ARHGEF28Q8N1W1 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
ARHGEF28Q8N1W1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
ARHGEF28Q8N1W1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ARHGEF28Q8N1W1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ARHGEF28Q8N1W1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ARHGEF28Q8N1W1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC33.76■■■□□ 2.99
ARHGEF28Q8N1W1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
ARHGEF28Q8N1W1 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ARHGEF28Q8N1W1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
ARHGEF28Q8N1W1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
ARHGEF28Q8N1W1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ARHGEF28Q8N1W1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ARHGEF28Q8N1W1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
ARHGEF28Q8N1W1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ARHGEF28Q8N1W1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ARHGEF28Q8N1W1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
ARHGEF28Q8N1W1 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ARHGEF28Q8N1W1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
ARHGEF28Q8N1W1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
ARHGEF28Q8N1W1 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ARHGEF28Q8N1W1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.72■■■□□ 2.99
ARHGEF28Q8N1W1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
ARHGEF28Q8N1W1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
ARHGEF28Q8N1W1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ARHGEF28Q8N1W1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ARHGEF28Q8N1W1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ARHGEF28Q8N1W1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
ARHGEF28Q8N1W1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
ARHGEF28Q8N1W1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
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