Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1G2

CMTR1, Cap-specific mRNA (nucleoside-2'-O-)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTR1Q8N1G2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CMTR1Q8N1G2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CMTR1Q8N1G2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CMTR1Q8N1G2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CMTR1Q8N1G2 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CMTR1Q8N1G2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CMTR1Q8N1G2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CMTR1Q8N1G2 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CMTR1Q8N1G2 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CMTR1Q8N1G2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CMTR1Q8N1G2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CMTR1Q8N1G2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CMTR1Q8N1G2 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CMTR1Q8N1G2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CMTR1Q8N1G2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CMTR1Q8N1G2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CMTR1Q8N1G2 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CMTR1Q8N1G2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CMTR1Q8N1G2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CMTR1Q8N1G2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CMTR1Q8N1G2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CMTR1Q8N1G2 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CMTR1Q8N1G2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CMTR1Q8N1G2 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CMTR1Q8N1G2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CMTR1Q8N1G2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CMTR1Q8N1G2 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CMTR1Q8N1G2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CMTR1Q8N1G2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CMTR1Q8N1G2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CMTR1Q8N1G2 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CMTR1Q8N1G2 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CMTR1Q8N1G2 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CMTR1Q8N1G2 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CMTR1Q8N1G2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CMTR1Q8N1G2 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CMTR1Q8N1G2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CMTR1Q8N1G2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CMTR1Q8N1G2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CMTR1Q8N1G2 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CMTR1Q8N1G2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CMTR1Q8N1G2 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CMTR1Q8N1G2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CMTR1Q8N1G2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CMTR1Q8N1G2 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CMTR1Q8N1G2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CMTR1Q8N1G2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CMTR1Q8N1G2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CMTR1Q8N1G2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CMTR1Q8N1G2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CMTR1Q8N1G2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CMTR1Q8N1G2 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CMTR1Q8N1G2 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CMTR1Q8N1G2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CMTR1Q8N1G2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CMTR1Q8N1G2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CMTR1Q8N1G2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CMTR1Q8N1G2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CMTR1Q8N1G2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CMTR1Q8N1G2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CMTR1Q8N1G2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CMTR1Q8N1G2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CMTR1Q8N1G2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CMTR1Q8N1G2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CMTR1Q8N1G2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CMTR1Q8N1G2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CMTR1Q8N1G2 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms