Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Hecw1Q8K4P8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Hecw1Q8K4P8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Hecw1Q8K4P8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
Hecw1Q8K4P8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Hecw1Q8K4P8 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Hecw1Q8K4P8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Hecw1Q8K4P8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Hecw1Q8K4P8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Hecw1Q8K4P8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Hecw1Q8K4P8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Hecw1Q8K4P8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Hecw1Q8K4P8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Hecw1Q8K4P8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
Hecw1Q8K4P8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Hecw1Q8K4P8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Hecw1Q8K4P8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Hecw1Q8K4P8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Hecw1Q8K4P8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Hecw1Q8K4P8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Hecw1Q8K4P8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
Hecw1Q8K4P8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Hecw1Q8K4P8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Hecw1Q8K4P8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Hecw1Q8K4P8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
Hecw1Q8K4P8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Hecw1Q8K4P8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Hecw1Q8K4P8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Hecw1Q8K4P8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Hecw1Q8K4P8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Hecw1Q8K4P8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
Hecw1Q8K4P8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Hecw1Q8K4P8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Hecw1Q8K4P8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Hecw1Q8K4P8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Hecw1Q8K4P8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Hecw1Q8K4P8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC32.51■■■□□ 2.8
Hecw1Q8K4P8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Hecw1Q8K4P8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Hecw1Q8K4P8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Hecw1Q8K4P8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Hecw1Q8K4P8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Hecw1Q8K4P8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Hecw1Q8K4P8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Hecw1Q8K4P8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Hecw1Q8K4P8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Hecw1Q8K4P8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Hecw1Q8K4P8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Hecw1Q8K4P8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Hecw1Q8K4P8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Hecw1Q8K4P8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Hecw1Q8K4P8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Hecw1Q8K4P8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
Hecw1Q8K4P8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Hecw1Q8K4P8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Hecw1Q8K4P8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Hecw1Q8K4P8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
Hecw1Q8K4P8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
Hecw1Q8K4P8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Hecw1Q8K4P8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Hecw1Q8K4P8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Hecw1Q8K4P8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
Hecw1Q8K4P8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Hecw1Q8K4P8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Hecw1Q8K4P8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Hecw1Q8K4P8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Hecw1Q8K4P8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Hecw1Q8K4P8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Hecw1Q8K4P8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
Hecw1Q8K4P8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Hecw1Q8K4P8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Hecw1Q8K4P8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
Hecw1Q8K4P8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Hecw1Q8K4P8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
Hecw1Q8K4P8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Hecw1Q8K4P8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Hecw1Q8K4P8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Hecw1Q8K4P8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Hecw1Q8K4P8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Hecw1Q8K4P8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
Hecw1Q8K4P8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Hecw1Q8K4P8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Hecw1Q8K4P8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
Hecw1Q8K4P8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Hecw1Q8K4P8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Hecw1Q8K4P8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Hecw1Q8K4P8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Hecw1Q8K4P8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
Hecw1Q8K4P8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Hecw1Q8K4P8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Hecw1Q8K4P8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Hecw1Q8K4P8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Hecw1Q8K4P8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Hecw1Q8K4P8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Hecw1Q8K4P8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Hecw1Q8K4P8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
Hecw1Q8K4P8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Hecw1Q8K4P8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Hecw1Q8K4P8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Hecw1Q8K4P8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms