Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3M1

Rdh16f2, Cis-retinol/3alpha hydroxysterol short-chain dehydrogenase-like protein, mousemouse

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f2Q8K3M1 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rdh16f2Q8K3M1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rdh16f2Q8K3M1 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Rdh16f2Q8K3M1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rdh16f2Q8K3M1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Rdh16f2Q8K3M1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rdh16f2Q8K3M1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rdh16f2Q8K3M1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rdh16f2Q8K3M1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rdh16f2Q8K3M1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rdh16f2Q8K3M1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rdh16f2Q8K3M1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rdh16f2Q8K3M1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rdh16f2Q8K3M1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rdh16f2Q8K3M1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rdh16f2Q8K3M1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rdh16f2Q8K3M1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Rdh16f2Q8K3M1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rdh16f2Q8K3M1 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Rdh16f2Q8K3M1 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rdh16f2Q8K3M1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rdh16f2Q8K3M1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rdh16f2Q8K3M1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rdh16f2Q8K3M1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Rdh16f2Q8K3M1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rdh16f2Q8K3M1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rdh16f2Q8K3M1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rdh16f2Q8K3M1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rdh16f2Q8K3M1 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rdh16f2Q8K3M1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rdh16f2Q8K3M1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rdh16f2Q8K3M1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rdh16f2Q8K3M1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rdh16f2Q8K3M1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rdh16f2Q8K3M1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rdh16f2Q8K3M1 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Rdh16f2Q8K3M1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rdh16f2Q8K3M1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rdh16f2Q8K3M1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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