Protein–RNA interactions for Protein: Q8K377

Lrrtm1, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm1Q8K377 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrtm1Q8K377 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrtm1Q8K377 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrtm1Q8K377 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Lrrtm1Q8K377 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrtm1Q8K377 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrtm1Q8K377 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrtm1Q8K377 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrtm1Q8K377 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Lrrtm1Q8K377 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrtm1Q8K377 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrtm1Q8K377 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrtm1Q8K377 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrtm1Q8K377 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrtm1Q8K377 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrtm1Q8K377 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrtm1Q8K377 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrtm1Q8K377 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Lrrtm1Q8K377 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrtm1Q8K377 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrtm1Q8K377 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Lrrtm1Q8K377 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Lrrtm1Q8K377 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrtm1Q8K377 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrtm1Q8K377 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrtm1Q8K377 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrtm1Q8K377 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrtm1Q8K377 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Lrrtm1Q8K377 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrtm1Q8K377 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrtm1Q8K377 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrtm1Q8K377 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrrtm1Q8K377 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrtm1Q8K377 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrtm1Q8K377 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrtm1Q8K377 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrtm1Q8K377 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrtm1Q8K377 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrtm1Q8K377 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrrtm1Q8K377 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrtm1Q8K377 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrtm1Q8K377 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrtm1Q8K377 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrtm1Q8K377 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrtm1Q8K377 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrtm1Q8K377 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrtm1Q8K377 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrrtm1Q8K377 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms