Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q9

Shtn1, Shootin-1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shtn1Q8K2Q9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Shtn1Q8K2Q9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Shtn1Q8K2Q9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Shtn1Q8K2Q9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Shtn1Q8K2Q9 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Shtn1Q8K2Q9 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Shtn1Q8K2Q9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Shtn1Q8K2Q9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Shtn1Q8K2Q9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Shtn1Q8K2Q9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Shtn1Q8K2Q9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Shtn1Q8K2Q9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Shtn1Q8K2Q9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Shtn1Q8K2Q9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Shtn1Q8K2Q9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Shtn1Q8K2Q9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Shtn1Q8K2Q9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Shtn1Q8K2Q9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Shtn1Q8K2Q9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Shtn1Q8K2Q9 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Shtn1Q8K2Q9 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Shtn1Q8K2Q9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Shtn1Q8K2Q9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Shtn1Q8K2Q9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Shtn1Q8K2Q9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Shtn1Q8K2Q9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
Shtn1Q8K2Q9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Shtn1Q8K2Q9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Shtn1Q8K2Q9 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Shtn1Q8K2Q9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Shtn1Q8K2Q9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Shtn1Q8K2Q9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Shtn1Q8K2Q9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Shtn1Q8K2Q9 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Shtn1Q8K2Q9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Shtn1Q8K2Q9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Shtn1Q8K2Q9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Shtn1Q8K2Q9 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Shtn1Q8K2Q9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Shtn1Q8K2Q9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Shtn1Q8K2Q9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Shtn1Q8K2Q9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Shtn1Q8K2Q9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Shtn1Q8K2Q9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Shtn1Q8K2Q9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Shtn1Q8K2Q9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Shtn1Q8K2Q9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Shtn1Q8K2Q9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Shtn1Q8K2Q9 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Shtn1Q8K2Q9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Shtn1Q8K2Q9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Shtn1Q8K2Q9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Shtn1Q8K2Q9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Shtn1Q8K2Q9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Shtn1Q8K2Q9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Shtn1Q8K2Q9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Shtn1Q8K2Q9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Shtn1Q8K2Q9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Shtn1Q8K2Q9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Shtn1Q8K2Q9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Shtn1Q8K2Q9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Shtn1Q8K2Q9 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Shtn1Q8K2Q9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Shtn1Q8K2Q9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Shtn1Q8K2Q9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Shtn1Q8K2Q9 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Shtn1Q8K2Q9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Shtn1Q8K2Q9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Shtn1Q8K2Q9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Shtn1Q8K2Q9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Shtn1Q8K2Q9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Shtn1Q8K2Q9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Shtn1Q8K2Q9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Shtn1Q8K2Q9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Shtn1Q8K2Q9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Shtn1Q8K2Q9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Shtn1Q8K2Q9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Shtn1Q8K2Q9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Shtn1Q8K2Q9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Shtn1Q8K2Q9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Shtn1Q8K2Q9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Shtn1Q8K2Q9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Shtn1Q8K2Q9 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Shtn1Q8K2Q9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Shtn1Q8K2Q9 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Shtn1Q8K2Q9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Shtn1Q8K2Q9 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Shtn1Q8K2Q9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Shtn1Q8K2Q9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Shtn1Q8K2Q9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Shtn1Q8K2Q9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Shtn1Q8K2Q9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Shtn1Q8K2Q9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Shtn1Q8K2Q9 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Shtn1Q8K2Q9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Shtn1Q8K2Q9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Shtn1Q8K2Q9 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Shtn1Q8K2Q9 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Shtn1Q8K2Q9 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Shtn1Q8K2Q9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms