Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1S6

Spire2, Protein spire homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire2Q8K1S6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Spire2Q8K1S6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Spire2Q8K1S6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Spire2Q8K1S6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Spire2Q8K1S6 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Spire2Q8K1S6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Spire2Q8K1S6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Spire2Q8K1S6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Spire2Q8K1S6 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Spire2Q8K1S6 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Spire2Q8K1S6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Spire2Q8K1S6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Spire2Q8K1S6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Spire2Q8K1S6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Spire2Q8K1S6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Spire2Q8K1S6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Spire2Q8K1S6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Spire2Q8K1S6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Spire2Q8K1S6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Spire2Q8K1S6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Spire2Q8K1S6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Spire2Q8K1S6 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Spire2Q8K1S6 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Spire2Q8K1S6 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Spire2Q8K1S6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Spire2Q8K1S6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Spire2Q8K1S6 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Spire2Q8K1S6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Spire2Q8K1S6 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Spire2Q8K1S6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Spire2Q8K1S6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Spire2Q8K1S6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Spire2Q8K1S6 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Spire2Q8K1S6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Spire2Q8K1S6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Spire2Q8K1S6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Spire2Q8K1S6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Spire2Q8K1S6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Spire2Q8K1S6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Spire2Q8K1S6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Spire2Q8K1S6 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Spire2Q8K1S6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Spire2Q8K1S6 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Spire2Q8K1S6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Spire2Q8K1S6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Spire2Q8K1S6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Spire2Q8K1S6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Spire2Q8K1S6 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Spire2Q8K1S6 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Spire2Q8K1S6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Spire2Q8K1S6 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Spire2Q8K1S6 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Spire2Q8K1S6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Spire2Q8K1S6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Spire2Q8K1S6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Spire2Q8K1S6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Spire2Q8K1S6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Spire2Q8K1S6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Spire2Q8K1S6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Spire2Q8K1S6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Spire2Q8K1S6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Spire2Q8K1S6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Spire2Q8K1S6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Spire2Q8K1S6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Spire2Q8K1S6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Spire2Q8K1S6 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Spire2Q8K1S6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Spire2Q8K1S6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Spire2Q8K1S6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Spire2Q8K1S6 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Spire2Q8K1S6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Spire2Q8K1S6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Spire2Q8K1S6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Spire2Q8K1S6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Spire2Q8K1S6 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Spire2Q8K1S6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Spire2Q8K1S6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Spire2Q8K1S6 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Spire2Q8K1S6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Spire2Q8K1S6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Spire2Q8K1S6 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Spire2Q8K1S6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Spire2Q8K1S6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Spire2Q8K1S6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Spire2Q8K1S6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Spire2Q8K1S6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Spire2Q8K1S6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Spire2Q8K1S6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Spire2Q8K1S6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Spire2Q8K1S6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Spire2Q8K1S6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Spire2Q8K1S6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Spire2Q8K1S6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Spire2Q8K1S6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Spire2Q8K1S6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Spire2Q8K1S6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Spire2Q8K1S6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Spire2Q8K1S6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Spire2Q8K1S6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Spire2Q8K1S6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 164.5 ms