Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Alkbh3Q8K1E6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Alkbh3Q8K1E6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Alkbh3Q8K1E6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Alkbh3Q8K1E6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Alkbh3Q8K1E6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Alkbh3Q8K1E6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.9 ms