Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0D5

Gfm1, Elongation factor G, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfm1Q8K0D5 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gfm1Q8K0D5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfm1Q8K0D5 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfm1Q8K0D5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfm1Q8K0D5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gfm1Q8K0D5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gfm1Q8K0D5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gfm1Q8K0D5 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gfm1Q8K0D5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Gfm1Q8K0D5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gfm1Q8K0D5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gfm1Q8K0D5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gfm1Q8K0D5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gfm1Q8K0D5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gfm1Q8K0D5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gfm1Q8K0D5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gfm1Q8K0D5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gfm1Q8K0D5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gfm1Q8K0D5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gfm1Q8K0D5 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gfm1Q8K0D5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gfm1Q8K0D5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gfm1Q8K0D5 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gfm1Q8K0D5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gfm1Q8K0D5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gfm1Q8K0D5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gfm1Q8K0D5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gfm1Q8K0D5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gfm1Q8K0D5 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gfm1Q8K0D5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gfm1Q8K0D5 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gfm1Q8K0D5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gfm1Q8K0D5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gfm1Q8K0D5 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gfm1Q8K0D5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gfm1Q8K0D5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gfm1Q8K0D5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gfm1Q8K0D5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gfm1Q8K0D5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gfm1Q8K0D5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gfm1Q8K0D5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gfm1Q8K0D5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gfm1Q8K0D5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfm1Q8K0D5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfm1Q8K0D5 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfm1Q8K0D5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfm1Q8K0D5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gfm1Q8K0D5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfm1Q8K0D5 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfm1Q8K0D5 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfm1Q8K0D5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfm1Q8K0D5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfm1Q8K0D5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfm1Q8K0D5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gfm1Q8K0D5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfm1Q8K0D5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfm1Q8K0D5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfm1Q8K0D5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gfm1Q8K0D5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfm1Q8K0D5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfm1Q8K0D5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfm1Q8K0D5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gfm1Q8K0D5 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gfm1Q8K0D5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gfm1Q8K0D5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gfm1Q8K0D5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gfm1Q8K0D5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gfm1Q8K0D5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gfm1Q8K0D5 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gfm1Q8K0D5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gfm1Q8K0D5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gfm1Q8K0D5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gfm1Q8K0D5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms