Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh2d5Q8JZW5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh2d5Q8JZW5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh2d5Q8JZW5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh2d5Q8JZW5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh2d5Q8JZW5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh2d5Q8JZW5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh2d5Q8JZW5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh2d5Q8JZW5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh2d5Q8JZW5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh2d5Q8JZW5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh2d5Q8JZW5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh2d5Q8JZW5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh2d5Q8JZW5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh2d5Q8JZW5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh2d5Q8JZW5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh2d5Q8JZW5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh2d5Q8JZW5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh2d5Q8JZW5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh2d5Q8JZW5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh2d5Q8JZW5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh2d5Q8JZW5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh2d5Q8JZW5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh2d5Q8JZW5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh2d5Q8JZW5 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh2d5Q8JZW5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh2d5Q8JZW5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh2d5Q8JZW5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh2d5Q8JZW5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh2d5Q8JZW5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh2d5Q8JZW5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh2d5Q8JZW5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh2d5Q8JZW5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Sh2d5Q8JZW5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh2d5Q8JZW5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh2d5Q8JZW5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh2d5Q8JZW5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh2d5Q8JZW5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Sh2d5Q8JZW5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh2d5Q8JZW5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh2d5Q8JZW5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh2d5Q8JZW5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh2d5Q8JZW5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Sh2d5Q8JZW5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh2d5Q8JZW5 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh2d5Q8JZW5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh2d5Q8JZW5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Sh2d5Q8JZW5 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh2d5Q8JZW5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh2d5Q8JZW5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh2d5Q8JZW5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh2d5Q8JZW5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh2d5Q8JZW5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh2d5Q8JZW5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh2d5Q8JZW5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sh2d5Q8JZW5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh2d5Q8JZW5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh2d5Q8JZW5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh2d5Q8JZW5 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh2d5Q8JZW5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh2d5Q8JZW5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh2d5Q8JZW5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh2d5Q8JZW5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Sh2d5Q8JZW5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh2d5Q8JZW5 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Sh2d5Q8JZW5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sh2d5Q8JZW5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh2d5Q8JZW5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh2d5Q8JZW5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh2d5Q8JZW5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh2d5Q8JZW5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh2d5Q8JZW5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sh2d5Q8JZW5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh2d5Q8JZW5 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh2d5Q8JZW5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh2d5Q8JZW5 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh2d5Q8JZW5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh2d5Q8JZW5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh2d5Q8JZW5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Sh2d5Q8JZW5 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh2d5Q8JZW5 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh2d5Q8JZW5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sh2d5Q8JZW5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh2d5Q8JZW5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh2d5Q8JZW5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh2d5Q8JZW5 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh2d5Q8JZW5 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh2d5Q8JZW5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh2d5Q8JZW5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sh2d5Q8JZW5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh2d5Q8JZW5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh2d5Q8JZW5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh2d5Q8JZW5 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sh2d5Q8JZW5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sh2d5Q8JZW5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Sh2d5Q8JZW5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh2d5Q8JZW5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Sh2d5Q8JZW5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh2d5Q8JZW5 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sh2d5Q8JZW5 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.3 ms