Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPUSD2Q8IZ73 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPUSD2Q8IZ73 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPUSD2Q8IZ73 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RPUSD2Q8IZ73 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPUSD2Q8IZ73 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPUSD2Q8IZ73 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPUSD2Q8IZ73 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPUSD2Q8IZ73 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPUSD2Q8IZ73 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPUSD2Q8IZ73 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RPUSD2Q8IZ73 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPUSD2Q8IZ73 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPUSD2Q8IZ73 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RPUSD2Q8IZ73 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPUSD2Q8IZ73 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RPUSD2Q8IZ73 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPUSD2Q8IZ73 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPUSD2Q8IZ73 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPUSD2Q8IZ73 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPUSD2Q8IZ73 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RPUSD2Q8IZ73 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
RPUSD2Q8IZ73 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPUSD2Q8IZ73 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPUSD2Q8IZ73 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPUSD2Q8IZ73 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPUSD2Q8IZ73 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPUSD2Q8IZ73 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RPUSD2Q8IZ73 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPUSD2Q8IZ73 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPUSD2Q8IZ73 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RPUSD2Q8IZ73 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RPUSD2Q8IZ73 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPUSD2Q8IZ73 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPUSD2Q8IZ73 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPUSD2Q8IZ73 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPUSD2Q8IZ73 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPUSD2Q8IZ73 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPUSD2Q8IZ73 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPUSD2Q8IZ73 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPUSD2Q8IZ73 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RPUSD2Q8IZ73 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPUSD2Q8IZ73 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPUSD2Q8IZ73 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPUSD2Q8IZ73 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPUSD2Q8IZ73 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPUSD2Q8IZ73 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RPUSD2Q8IZ73 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPUSD2Q8IZ73 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPUSD2Q8IZ73 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPUSD2Q8IZ73 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPUSD2Q8IZ73 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RPUSD2Q8IZ73 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPUSD2Q8IZ73 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPUSD2Q8IZ73 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPUSD2Q8IZ73 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPUSD2Q8IZ73 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPUSD2Q8IZ73 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RPUSD2Q8IZ73 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPUSD2Q8IZ73 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RPUSD2Q8IZ73 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPUSD2Q8IZ73 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RPUSD2Q8IZ73 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPUSD2Q8IZ73 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPUSD2Q8IZ73 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPUSD2Q8IZ73 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPUSD2Q8IZ73 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RPUSD2Q8IZ73 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPUSD2Q8IZ73 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RPUSD2Q8IZ73 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPUSD2Q8IZ73 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RPUSD2Q8IZ73 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RPUSD2Q8IZ73 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPUSD2Q8IZ73 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPUSD2Q8IZ73 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPUSD2Q8IZ73 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RPUSD2Q8IZ73 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPUSD2Q8IZ73 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPUSD2Q8IZ73 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RPUSD2Q8IZ73 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
RPUSD2Q8IZ73 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPUSD2Q8IZ73 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPUSD2Q8IZ73 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPUSD2Q8IZ73 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPUSD2Q8IZ73 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RPUSD2Q8IZ73 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPUSD2Q8IZ73 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPUSD2Q8IZ73 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPUSD2Q8IZ73 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPUSD2Q8IZ73 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPUSD2Q8IZ73 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPUSD2Q8IZ73 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPUSD2Q8IZ73 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPUSD2Q8IZ73 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPUSD2Q8IZ73 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RPUSD2Q8IZ73 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPUSD2Q8IZ73 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RPUSD2Q8IZ73 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RPUSD2Q8IZ73 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
RPUSD2Q8IZ73 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms