Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ6

PARP9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP9Q8IXQ6 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PARP9Q8IXQ6 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PARP9Q8IXQ6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PARP9Q8IXQ6 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PARP9Q8IXQ6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PARP9Q8IXQ6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PARP9Q8IXQ6 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PARP9Q8IXQ6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
PARP9Q8IXQ6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PARP9Q8IXQ6 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PARP9Q8IXQ6 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PARP9Q8IXQ6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PARP9Q8IXQ6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PARP9Q8IXQ6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP9Q8IXQ6 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP9Q8IXQ6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP9Q8IXQ6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP9Q8IXQ6 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PARP9Q8IXQ6 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP9Q8IXQ6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP9Q8IXQ6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP9Q8IXQ6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP9Q8IXQ6 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PARP9Q8IXQ6 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARP9Q8IXQ6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PARP9Q8IXQ6 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP9Q8IXQ6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP9Q8IXQ6 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PARP9Q8IXQ6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PARP9Q8IXQ6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms