Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ4

GPALPP1, GPALPP motifs-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPALPP1Q8IXQ4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPALPP1Q8IXQ4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPALPP1Q8IXQ4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GPALPP1Q8IXQ4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GPALPP1Q8IXQ4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPALPP1Q8IXQ4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPALPP1Q8IXQ4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GPALPP1Q8IXQ4 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GPALPP1Q8IXQ4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GPALPP1Q8IXQ4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GPALPP1Q8IXQ4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPALPP1Q8IXQ4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPALPP1Q8IXQ4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GPALPP1Q8IXQ4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPALPP1Q8IXQ4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPALPP1Q8IXQ4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPALPP1Q8IXQ4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPALPP1Q8IXQ4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPALPP1Q8IXQ4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GPALPP1Q8IXQ4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPALPP1Q8IXQ4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPALPP1Q8IXQ4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPALPP1Q8IXQ4 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPALPP1Q8IXQ4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPALPP1Q8IXQ4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPALPP1Q8IXQ4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPALPP1Q8IXQ4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GPALPP1Q8IXQ4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPALPP1Q8IXQ4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPALPP1Q8IXQ4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPALPP1Q8IXQ4 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPALPP1Q8IXQ4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPALPP1Q8IXQ4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GPALPP1Q8IXQ4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GPALPP1Q8IXQ4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GPALPP1Q8IXQ4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
GPALPP1Q8IXQ4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPALPP1Q8IXQ4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPALPP1Q8IXQ4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
GPALPP1Q8IXQ4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPALPP1Q8IXQ4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GPALPP1Q8IXQ4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPALPP1Q8IXQ4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPALPP1Q8IXQ4 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GPALPP1Q8IXQ4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
GPALPP1Q8IXQ4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPALPP1Q8IXQ4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPALPP1Q8IXQ4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPALPP1Q8IXQ4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPALPP1Q8IXQ4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPALPP1Q8IXQ4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
GPALPP1Q8IXQ4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
GPALPP1Q8IXQ4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms