Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC83Q8IWF9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC83Q8IWF9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC83Q8IWF9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC83Q8IWF9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CCDC83Q8IWF9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC83Q8IWF9 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC83Q8IWF9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC83Q8IWF9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC83Q8IWF9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC83Q8IWF9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC83Q8IWF9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC83Q8IWF9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC83Q8IWF9 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC83Q8IWF9 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC83Q8IWF9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC83Q8IWF9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC83Q8IWF9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC83Q8IWF9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC83Q8IWF9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC83Q8IWF9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC83Q8IWF9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC83Q8IWF9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC83Q8IWF9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC83Q8IWF9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC83Q8IWF9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC83Q8IWF9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC83Q8IWF9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC83Q8IWF9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC83Q8IWF9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC83Q8IWF9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC83Q8IWF9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC83Q8IWF9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC83Q8IWF9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC83Q8IWF9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC83Q8IWF9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC83Q8IWF9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC83Q8IWF9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC83Q8IWF9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC83Q8IWF9 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC83Q8IWF9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC83Q8IWF9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC83Q8IWF9 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC83Q8IWF9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC83Q8IWF9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC83Q8IWF9 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC83Q8IWF9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC83Q8IWF9 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC83Q8IWF9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC83Q8IWF9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC83Q8IWF9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC83Q8IWF9 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC83Q8IWF9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC83Q8IWF9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC83Q8IWF9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC83Q8IWF9 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC83Q8IWF9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC83Q8IWF9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC83Q8IWF9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC83Q8IWF9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC83Q8IWF9 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC83Q8IWF9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC83Q8IWF9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC83Q8IWF9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC83Q8IWF9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC83Q8IWF9 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC83Q8IWF9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC83Q8IWF9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC83Q8IWF9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC83Q8IWF9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC83Q8IWF9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC83Q8IWF9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC83Q8IWF9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC83Q8IWF9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC83Q8IWF9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC83Q8IWF9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC83Q8IWF9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC83Q8IWF9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CCDC83Q8IWF9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC83Q8IWF9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC83Q8IWF9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC83Q8IWF9 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC83Q8IWF9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CCDC83Q8IWF9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC83Q8IWF9 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC83Q8IWF9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC83Q8IWF9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CCDC83Q8IWF9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC83Q8IWF9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC83Q8IWF9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC83Q8IWF9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC83Q8IWF9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC83Q8IWF9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CCDC83Q8IWF9 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC83Q8IWF9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC83Q8IWF9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC83Q8IWF9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC83Q8IWF9 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CCDC83Q8IWF9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CCDC83Q8IWF9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms