Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV77

CNGA4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA4Q8IV77 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CNGA4Q8IV77 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CNGA4Q8IV77 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CNGA4Q8IV77 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.2 ms