Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV35

WDR49, WD repeat-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR49Q8IV35 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
WDR49Q8IV35 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
WDR49Q8IV35 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
WDR49Q8IV35 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR49Q8IV35 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR49Q8IV35 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR49Q8IV35 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR49Q8IV35 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR49Q8IV35 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
WDR49Q8IV35 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR49Q8IV35 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR49Q8IV35 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR49Q8IV35 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR49Q8IV35 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR49Q8IV35 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
WDR49Q8IV35 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR49Q8IV35 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR49Q8IV35 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR49Q8IV35 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR49Q8IV35 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR49Q8IV35 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
WDR49Q8IV35 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
WDR49Q8IV35 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
WDR49Q8IV35 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
WDR49Q8IV35 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
WDR49Q8IV35 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
WDR49Q8IV35 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
WDR49Q8IV35 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
WDR49Q8IV35 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
WDR49Q8IV35 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
WDR49Q8IV35 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
WDR49Q8IV35 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
WDR49Q8IV35 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
WDR49Q8IV35 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
WDR49Q8IV35 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
WDR49Q8IV35 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
WDR49Q8IV35 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
WDR49Q8IV35 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
WDR49Q8IV35 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
WDR49Q8IV35 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
WDR49Q8IV35 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WDR49Q8IV35 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WDR49Q8IV35 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
WDR49Q8IV35 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
WDR49Q8IV35 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
WDR49Q8IV35 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
WDR49Q8IV35 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
WDR49Q8IV35 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
WDR49Q8IV35 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
WDR49Q8IV35 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
WDR49Q8IV35 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
WDR49Q8IV35 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
WDR49Q8IV35 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
WDR49Q8IV35 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms