Protein–RNA interactions for Protein: Q8CII8

Syne4, Nesprin-4, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne4Q8CII8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Syne4Q8CII8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syne4Q8CII8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syne4Q8CII8 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syne4Q8CII8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syne4Q8CII8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syne4Q8CII8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syne4Q8CII8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Syne4Q8CII8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Syne4Q8CII8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Syne4Q8CII8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Syne4Q8CII8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syne4Q8CII8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syne4Q8CII8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syne4Q8CII8 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syne4Q8CII8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syne4Q8CII8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syne4Q8CII8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Syne4Q8CII8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Syne4Q8CII8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syne4Q8CII8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syne4Q8CII8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syne4Q8CII8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syne4Q8CII8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syne4Q8CII8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syne4Q8CII8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syne4Q8CII8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syne4Q8CII8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syne4Q8CII8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syne4Q8CII8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Syne4Q8CII8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Syne4Q8CII8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Syne4Q8CII8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syne4Q8CII8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syne4Q8CII8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syne4Q8CII8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syne4Q8CII8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syne4Q8CII8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syne4Q8CII8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syne4Q8CII8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syne4Q8CII8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syne4Q8CII8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syne4Q8CII8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syne4Q8CII8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syne4Q8CII8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Syne4Q8CII8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Syne4Q8CII8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Syne4Q8CII8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Syne4Q8CII8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Syne4Q8CII8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Syne4Q8CII8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syne4Q8CII8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syne4Q8CII8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syne4Q8CII8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syne4Q8CII8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syne4Q8CII8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syne4Q8CII8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Syne4Q8CII8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Syne4Q8CII8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Syne4Q8CII8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Syne4Q8CII8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Syne4Q8CII8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Syne4Q8CII8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Syne4Q8CII8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Syne4Q8CII8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Syne4Q8CII8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Syne4Q8CII8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Syne4Q8CII8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Syne4Q8CII8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Syne4Q8CII8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syne4Q8CII8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syne4Q8CII8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Syne4Q8CII8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Syne4Q8CII8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syne4Q8CII8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syne4Q8CII8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syne4Q8CII8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syne4Q8CII8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syne4Q8CII8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syne4Q8CII8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syne4Q8CII8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syne4Q8CII8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Syne4Q8CII8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Syne4Q8CII8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Syne4Q8CII8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Syne4Q8CII8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Syne4Q8CII8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Syne4Q8CII8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Syne4Q8CII8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Syne4Q8CII8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syne4Q8CII8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syne4Q8CII8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syne4Q8CII8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Syne4Q8CII8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Syne4Q8CII8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Syne4Q8CII8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syne4Q8CII8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syne4Q8CII8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syne4Q8CII8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Syne4Q8CII8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms