Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGZ0

Cherp, Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CherpQ8CGZ0 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CherpQ8CGZ0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CherpQ8CGZ0 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CherpQ8CGZ0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CherpQ8CGZ0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CherpQ8CGZ0 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CherpQ8CGZ0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CherpQ8CGZ0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CherpQ8CGZ0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CherpQ8CGZ0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CherpQ8CGZ0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CherpQ8CGZ0 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CherpQ8CGZ0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CherpQ8CGZ0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CherpQ8CGZ0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CherpQ8CGZ0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CherpQ8CGZ0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CherpQ8CGZ0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CherpQ8CGZ0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CherpQ8CGZ0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CherpQ8CGZ0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CherpQ8CGZ0 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CherpQ8CGZ0 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CherpQ8CGZ0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CherpQ8CGZ0 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CherpQ8CGZ0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CherpQ8CGZ0 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CherpQ8CGZ0 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CherpQ8CGZ0 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CherpQ8CGZ0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CherpQ8CGZ0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CherpQ8CGZ0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CherpQ8CGZ0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CherpQ8CGZ0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CherpQ8CGZ0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CherpQ8CGZ0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CherpQ8CGZ0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CherpQ8CGZ0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CherpQ8CGZ0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CherpQ8CGZ0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CherpQ8CGZ0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CherpQ8CGZ0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CherpQ8CGZ0 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CherpQ8CGZ0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CherpQ8CGZ0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CherpQ8CGZ0 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CherpQ8CGZ0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CherpQ8CGZ0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CherpQ8CGZ0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CherpQ8CGZ0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CherpQ8CGZ0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CherpQ8CGZ0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CherpQ8CGZ0 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CherpQ8CGZ0 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CherpQ8CGZ0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CherpQ8CGZ0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CherpQ8CGZ0 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CherpQ8CGZ0 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CherpQ8CGZ0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CherpQ8CGZ0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CherpQ8CGZ0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CherpQ8CGZ0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CherpQ8CGZ0 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CherpQ8CGZ0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CherpQ8CGZ0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CherpQ8CGZ0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CherpQ8CGZ0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CherpQ8CGZ0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CherpQ8CGZ0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CherpQ8CGZ0 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CherpQ8CGZ0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CherpQ8CGZ0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CherpQ8CGZ0 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
CherpQ8CGZ0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CherpQ8CGZ0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CherpQ8CGZ0 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CherpQ8CGZ0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CherpQ8CGZ0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CherpQ8CGZ0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CherpQ8CGZ0 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CherpQ8CGZ0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CherpQ8CGZ0 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CherpQ8CGZ0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CherpQ8CGZ0 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CherpQ8CGZ0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CherpQ8CGZ0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CherpQ8CGZ0 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CherpQ8CGZ0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CherpQ8CGZ0 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CherpQ8CGZ0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CherpQ8CGZ0 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CherpQ8CGZ0 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CherpQ8CGZ0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CherpQ8CGZ0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CherpQ8CGZ0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CherpQ8CGZ0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CherpQ8CGZ0 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CherpQ8CGZ0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CherpQ8CGZ0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CherpQ8CGZ0 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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