Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rbm28Q8CGC6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rbm28Q8CGC6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rbm28Q8CGC6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rbm28Q8CGC6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rbm28Q8CGC6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rbm28Q8CGC6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rbm28Q8CGC6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rbm28Q8CGC6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rbm28Q8CGC6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Rbm28Q8CGC6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rbm28Q8CGC6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rbm28Q8CGC6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Rbm28Q8CGC6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rbm28Q8CGC6 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rbm28Q8CGC6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rbm28Q8CGC6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rbm28Q8CGC6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rbm28Q8CGC6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rbm28Q8CGC6 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rbm28Q8CGC6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rbm28Q8CGC6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rbm28Q8CGC6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rbm28Q8CGC6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rbm28Q8CGC6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rbm28Q8CGC6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rbm28Q8CGC6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Rbm28Q8CGC6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rbm28Q8CGC6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rbm28Q8CGC6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rbm28Q8CGC6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rbm28Q8CGC6 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rbm28Q8CGC6 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Rbm28Q8CGC6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rbm28Q8CGC6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Rbm28Q8CGC6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rbm28Q8CGC6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rbm28Q8CGC6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rbm28Q8CGC6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rbm28Q8CGC6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rbm28Q8CGC6 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Rbm28Q8CGC6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rbm28Q8CGC6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rbm28Q8CGC6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rbm28Q8CGC6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Rbm28Q8CGC6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rbm28Q8CGC6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rbm28Q8CGC6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rbm28Q8CGC6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Rbm28Q8CGC6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rbm28Q8CGC6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Rbm28Q8CGC6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rbm28Q8CGC6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rbm28Q8CGC6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rbm28Q8CGC6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rbm28Q8CGC6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Rbm28Q8CGC6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rbm28Q8CGC6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rbm28Q8CGC6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Rbm28Q8CGC6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rbm28Q8CGC6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rbm28Q8CGC6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Rbm28Q8CGC6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rbm28Q8CGC6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Rbm28Q8CGC6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Rbm28Q8CGC6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Rbm28Q8CGC6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Rbm28Q8CGC6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rbm28Q8CGC6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rbm28Q8CGC6 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rbm28Q8CGC6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rbm28Q8CGC6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rbm28Q8CGC6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Rbm28Q8CGC6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rbm28Q8CGC6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rbm28Q8CGC6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Rbm28Q8CGC6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rbm28Q8CGC6 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rbm28Q8CGC6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rbm28Q8CGC6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rbm28Q8CGC6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rbm28Q8CGC6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Rbm28Q8CGC6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rbm28Q8CGC6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rbm28Q8CGC6 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rbm28Q8CGC6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rbm28Q8CGC6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rbm28Q8CGC6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Rbm28Q8CGC6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rbm28Q8CGC6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rbm28Q8CGC6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rbm28Q8CGC6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rbm28Q8CGC6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Rbm28Q8CGC6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rbm28Q8CGC6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rbm28Q8CGC6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Rbm28Q8CGC6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rbm28Q8CGC6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rbm28Q8CGC6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rbm28Q8CGC6 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
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