Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC88

Vwa8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa8Q8CC88 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwa8Q8CC88 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwa8Q8CC88 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vwa8Q8CC88 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vwa8Q8CC88 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vwa8Q8CC88 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vwa8Q8CC88 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vwa8Q8CC88 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Vwa8Q8CC88 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vwa8Q8CC88 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vwa8Q8CC88 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vwa8Q8CC88 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vwa8Q8CC88 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vwa8Q8CC88 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vwa8Q8CC88 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vwa8Q8CC88 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vwa8Q8CC88 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vwa8Q8CC88 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vwa8Q8CC88 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vwa8Q8CC88 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vwa8Q8CC88 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vwa8Q8CC88 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vwa8Q8CC88 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vwa8Q8CC88 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vwa8Q8CC88 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vwa8Q8CC88 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vwa8Q8CC88 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vwa8Q8CC88 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vwa8Q8CC88 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vwa8Q8CC88 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vwa8Q8CC88 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vwa8Q8CC88 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vwa8Q8CC88 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vwa8Q8CC88 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vwa8Q8CC88 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vwa8Q8CC88 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vwa8Q8CC88 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vwa8Q8CC88 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vwa8Q8CC88 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Vwa8Q8CC88 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Vwa8Q8CC88 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vwa8Q8CC88 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Vwa8Q8CC88 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Vwa8Q8CC88 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vwa8Q8CC88 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vwa8Q8CC88 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Vwa8Q8CC88 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Vwa8Q8CC88 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vwa8Q8CC88 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vwa8Q8CC88 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vwa8Q8CC88 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vwa8Q8CC88 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vwa8Q8CC88 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vwa8Q8CC88 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vwa8Q8CC88 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Vwa8Q8CC88 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vwa8Q8CC88 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vwa8Q8CC88 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vwa8Q8CC88 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vwa8Q8CC88 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Vwa8Q8CC88 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vwa8Q8CC88 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vwa8Q8CC88 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vwa8Q8CC88 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vwa8Q8CC88 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vwa8Q8CC88 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vwa8Q8CC88 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Vwa8Q8CC88 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vwa8Q8CC88 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vwa8Q8CC88 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vwa8Q8CC88 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vwa8Q8CC88 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vwa8Q8CC88 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Vwa8Q8CC88 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vwa8Q8CC88 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vwa8Q8CC88 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vwa8Q8CC88 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vwa8Q8CC88 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vwa8Q8CC88 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vwa8Q8CC88 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vwa8Q8CC88 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vwa8Q8CC88 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vwa8Q8CC88 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Vwa8Q8CC88 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vwa8Q8CC88 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Vwa8Q8CC88 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vwa8Q8CC88 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vwa8Q8CC88 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vwa8Q8CC88 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Vwa8Q8CC88 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vwa8Q8CC88 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vwa8Q8CC88 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vwa8Q8CC88 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Vwa8Q8CC88 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vwa8Q8CC88 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vwa8Q8CC88 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vwa8Q8CC88 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vwa8Q8CC88 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vwa8Q8CC88 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Vwa8Q8CC88 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms