Protein–RNA interactions for Protein: Q8CC27

Cacnb2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacnb2Q8CC27 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacnb2Q8CC27 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacnb2Q8CC27 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacnb2Q8CC27 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cacnb2Q8CC27 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cacnb2Q8CC27 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacnb2Q8CC27 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacnb2Q8CC27 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacnb2Q8CC27 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacnb2Q8CC27 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cacnb2Q8CC27 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacnb2Q8CC27 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacnb2Q8CC27 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacnb2Q8CC27 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacnb2Q8CC27 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacnb2Q8CC27 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cacnb2Q8CC27 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacnb2Q8CC27 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacnb2Q8CC27 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacnb2Q8CC27 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacnb2Q8CC27 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacnb2Q8CC27 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacnb2Q8CC27 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cacnb2Q8CC27 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacnb2Q8CC27 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacnb2Q8CC27 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacnb2Q8CC27 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacnb2Q8CC27 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacnb2Q8CC27 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cacnb2Q8CC27 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacnb2Q8CC27 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacnb2Q8CC27 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacnb2Q8CC27 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cacnb2Q8CC27 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacnb2Q8CC27 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cacnb2Q8CC27 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Cacnb2Q8CC27 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacnb2Q8CC27 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacnb2Q8CC27 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacnb2Q8CC27 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacnb2Q8CC27 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cacnb2Q8CC27 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacnb2Q8CC27 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacnb2Q8CC27 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacnb2Q8CC27 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacnb2Q8CC27 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Cacnb2Q8CC27 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacnb2Q8CC27 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacnb2Q8CC27 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacnb2Q8CC27 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cacnb2Q8CC27 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacnb2Q8CC27 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacnb2Q8CC27 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacnb2Q8CC27 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cacnb2Q8CC27 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacnb2Q8CC27 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacnb2Q8CC27 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacnb2Q8CC27 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacnb2Q8CC27 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacnb2Q8CC27 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacnb2Q8CC27 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cacnb2Q8CC27 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacnb2Q8CC27 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacnb2Q8CC27 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacnb2Q8CC27 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacnb2Q8CC27 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacnb2Q8CC27 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacnb2Q8CC27 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cacnb2Q8CC27 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cacnb2Q8CC27 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 129.4 ms