Protein–RNA interactions for Protein: Q8C310

Robo4, Roundabout homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo4Q8C310 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Robo4Q8C310 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Robo4Q8C310 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Robo4Q8C310 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Robo4Q8C310 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Robo4Q8C310 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Robo4Q8C310 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Robo4Q8C310 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Robo4Q8C310 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Robo4Q8C310 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Robo4Q8C310 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Robo4Q8C310 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Robo4Q8C310 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Robo4Q8C310 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Robo4Q8C310 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Robo4Q8C310 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Robo4Q8C310 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Robo4Q8C310 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Robo4Q8C310 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Robo4Q8C310 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Robo4Q8C310 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Robo4Q8C310 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Robo4Q8C310 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Robo4Q8C310 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Robo4Q8C310 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Robo4Q8C310 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Robo4Q8C310 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Robo4Q8C310 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Robo4Q8C310 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Robo4Q8C310 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Robo4Q8C310 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Robo4Q8C310 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Robo4Q8C310 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Robo4Q8C310 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Robo4Q8C310 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Robo4Q8C310 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Robo4Q8C310 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Robo4Q8C310 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Robo4Q8C310 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Robo4Q8C310 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Robo4Q8C310 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Robo4Q8C310 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Robo4Q8C310 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Robo4Q8C310 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Robo4Q8C310 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Robo4Q8C310 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Robo4Q8C310 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Robo4Q8C310 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Robo4Q8C310 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Robo4Q8C310 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Robo4Q8C310 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Robo4Q8C310 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Robo4Q8C310 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Robo4Q8C310 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Robo4Q8C310 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Robo4Q8C310 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Robo4Q8C310 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms