Protein–RNA interactions for Protein: Q8C159

Ttc22, Tetratricopeptide repeat protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc22Q8C159 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc22Q8C159 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc22Q8C159 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc22Q8C159 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc22Q8C159 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc22Q8C159 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc22Q8C159 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc22Q8C159 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc22Q8C159 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc22Q8C159 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc22Q8C159 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc22Q8C159 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc22Q8C159 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc22Q8C159 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc22Q8C159 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc22Q8C159 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc22Q8C159 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc22Q8C159 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc22Q8C159 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc22Q8C159 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc22Q8C159 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttc22Q8C159 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc22Q8C159 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc22Q8C159 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc22Q8C159 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc22Q8C159 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc22Q8C159 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttc22Q8C159 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc22Q8C159 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc22Q8C159 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc22Q8C159 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc22Q8C159 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc22Q8C159 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc22Q8C159 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc22Q8C159 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttc22Q8C159 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc22Q8C159 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc22Q8C159 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc22Q8C159 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc22Q8C159 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc22Q8C159 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttc22Q8C159 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc22Q8C159 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc22Q8C159 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc22Q8C159 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc22Q8C159 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc22Q8C159 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttc22Q8C159 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc22Q8C159 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc22Q8C159 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc22Q8C159 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc22Q8C159 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc22Q8C159 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc22Q8C159 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc22Q8C159 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ttc22Q8C159 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc22Q8C159 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc22Q8C159 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc22Q8C159 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ttc22Q8C159 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc22Q8C159 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc22Q8C159 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc22Q8C159 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ttc22Q8C159 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc22Q8C159 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc22Q8C159 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc22Q8C159 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc22Q8C159 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc22Q8C159 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc22Q8C159 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc22Q8C159 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ttc22Q8C159 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc22Q8C159 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc22Q8C159 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc22Q8C159 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc22Q8C159 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ttc22Q8C159 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc22Q8C159 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc22Q8C159 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc22Q8C159 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc22Q8C159 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc22Q8C159 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ttc22Q8C159 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ttc22Q8C159 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ttc22Q8C159 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms