Protein–RNA interactions for Protein: Q8BZL8

Lmo3, LIM domain only protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo3Q8BZL8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmo3Q8BZL8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmo3Q8BZL8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Lmo3Q8BZL8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmo3Q8BZL8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmo3Q8BZL8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmo3Q8BZL8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmo3Q8BZL8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmo3Q8BZL8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmo3Q8BZL8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Lmo3Q8BZL8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmo3Q8BZL8 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmo3Q8BZL8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmo3Q8BZL8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmo3Q8BZL8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmo3Q8BZL8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmo3Q8BZL8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmo3Q8BZL8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Lmo3Q8BZL8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmo3Q8BZL8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmo3Q8BZL8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmo3Q8BZL8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmo3Q8BZL8 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmo3Q8BZL8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Lmo3Q8BZL8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lmo3Q8BZL8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmo3Q8BZL8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmo3Q8BZL8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lmo3Q8BZL8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmo3Q8BZL8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmo3Q8BZL8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmo3Q8BZL8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lmo3Q8BZL8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmo3Q8BZL8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmo3Q8BZL8 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmo3Q8BZL8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lmo3Q8BZL8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmo3Q8BZL8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmo3Q8BZL8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmo3Q8BZL8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lmo3Q8BZL8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmo3Q8BZL8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmo3Q8BZL8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmo3Q8BZL8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lmo3Q8BZL8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmo3Q8BZL8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmo3Q8BZL8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmo3Q8BZL8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lmo3Q8BZL8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lmo3Q8BZL8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms