Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX90

Fndc3a, Fibronectin type-III domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 1,198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3aQ8BX90 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fndc3aQ8BX90 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc3aQ8BX90 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc3aQ8BX90 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc3aQ8BX90 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc3aQ8BX90 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc3aQ8BX90 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc3aQ8BX90 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc3aQ8BX90 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc3aQ8BX90 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Fndc3aQ8BX90 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fndc3aQ8BX90 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fndc3aQ8BX90 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fndc3aQ8BX90 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fndc3aQ8BX90 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fndc3aQ8BX90 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fndc3aQ8BX90 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Fndc3aQ8BX90 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fndc3aQ8BX90 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fndc3aQ8BX90 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fndc3aQ8BX90 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Fndc3aQ8BX90 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc3aQ8BX90 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc3aQ8BX90 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc3aQ8BX90 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc3aQ8BX90 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc3aQ8BX90 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Fndc3aQ8BX90 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc3aQ8BX90 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc3aQ8BX90 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc3aQ8BX90 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Fndc3aQ8BX90 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc3aQ8BX90 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc3aQ8BX90 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc3aQ8BX90 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc3aQ8BX90 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc3aQ8BX90 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Fndc3aQ8BX90 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc3aQ8BX90 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc3aQ8BX90 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Fndc3aQ8BX90 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc3aQ8BX90 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Fndc3aQ8BX90 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc3aQ8BX90 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc3aQ8BX90 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc3aQ8BX90 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Fndc3aQ8BX90 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Fndc3aQ8BX90 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Fndc3aQ8BX90 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms