Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Ccdc30Q8BVF4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc30Q8BVF4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc30Q8BVF4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc30Q8BVF4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc30Q8BVF4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc30Q8BVF4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc30Q8BVF4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc30Q8BVF4 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc30Q8BVF4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc30Q8BVF4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Ccdc30Q8BVF4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc30Q8BVF4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc30Q8BVF4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Ccdc30Q8BVF4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc30Q8BVF4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc30Q8BVF4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc30Q8BVF4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc30Q8BVF4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc30Q8BVF4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc30Q8BVF4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc30Q8BVF4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc30Q8BVF4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc30Q8BVF4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ccdc30Q8BVF4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc30Q8BVF4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc30Q8BVF4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc30Q8BVF4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc30Q8BVF4 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc30Q8BVF4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc30Q8BVF4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc30Q8BVF4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc30Q8BVF4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc30Q8BVF4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc30Q8BVF4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc30Q8BVF4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Ccdc30Q8BVF4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc30Q8BVF4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc30Q8BVF4 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc30Q8BVF4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc30Q8BVF4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc30Q8BVF4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Ccdc30Q8BVF4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc30Q8BVF4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc30Q8BVF4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc30Q8BVF4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc30Q8BVF4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc30Q8BVF4 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc30Q8BVF4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc30Q8BVF4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc30Q8BVF4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc30Q8BVF4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc30Q8BVF4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc30Q8BVF4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc30Q8BVF4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Ccdc30Q8BVF4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccdc30Q8BVF4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccdc30Q8BVF4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Ccdc30Q8BVF4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc30Q8BVF4 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc30Q8BVF4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc30Q8BVF4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc30Q8BVF4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc30Q8BVF4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Ccdc30Q8BVF4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc30Q8BVF4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc30Q8BVF4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc30Q8BVF4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc30Q8BVF4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Ccdc30Q8BVF4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc30Q8BVF4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc30Q8BVF4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc30Q8BVF4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Ccdc30Q8BVF4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc30Q8BVF4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc30Q8BVF4 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc30Q8BVF4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc30Q8BVF4 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc30Q8BVF4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc30Q8BVF4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc30Q8BVF4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc30Q8BVF4 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc30Q8BVF4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc30Q8BVF4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc30Q8BVF4 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc30Q8BVF4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc30Q8BVF4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Ccdc30Q8BVF4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc30Q8BVF4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc30Q8BVF4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc30Q8BVF4 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc30Q8BVF4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc30Q8BVF4 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ccdc30Q8BVF4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc30Q8BVF4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc30Q8BVF4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc30Q8BVF4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc30Q8BVF4 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc30Q8BVF4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms