Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Grik4Q8BMF5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Grik4Q8BMF5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Grik4Q8BMF5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Grik4Q8BMF5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Grik4Q8BMF5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Grik4Q8BMF5 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Grik4Q8BMF5 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Grik4Q8BMF5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Grik4Q8BMF5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Grik4Q8BMF5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Grik4Q8BMF5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Grik4Q8BMF5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Grik4Q8BMF5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Grik4Q8BMF5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Grik4Q8BMF5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Grik4Q8BMF5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Grik4Q8BMF5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Grik4Q8BMF5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Grik4Q8BMF5 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Grik4Q8BMF5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Grik4Q8BMF5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Grik4Q8BMF5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Grik4Q8BMF5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grik4Q8BMF5 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grik4Q8BMF5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grik4Q8BMF5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Grik4Q8BMF5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grik4Q8BMF5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grik4Q8BMF5 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grik4Q8BMF5 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grik4Q8BMF5 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grik4Q8BMF5 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grik4Q8BMF5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Grik4Q8BMF5 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Grik4Q8BMF5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Grik4Q8BMF5 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Grik4Q8BMF5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Grik4Q8BMF5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Grik4Q8BMF5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Grik4Q8BMF5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Grik4Q8BMF5 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Grik4Q8BMF5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Grik4Q8BMF5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grik4Q8BMF5 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Grik4Q8BMF5 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grik4Q8BMF5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grik4Q8BMF5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grik4Q8BMF5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Grik4Q8BMF5 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Grik4Q8BMF5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Grik4Q8BMF5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Grik4Q8BMF5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Grik4Q8BMF5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Grik4Q8BMF5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Grik4Q8BMF5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Grik4Q8BMF5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Grik4Q8BMF5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Grik4Q8BMF5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Grik4Q8BMF5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Grik4Q8BMF5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Grik4Q8BMF5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Grik4Q8BMF5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Grik4Q8BMF5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Grik4Q8BMF5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Grik4Q8BMF5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Grik4Q8BMF5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Grik4Q8BMF5 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Grik4Q8BMF5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Grik4Q8BMF5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Grik4Q8BMF5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Grik4Q8BMF5 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Grik4Q8BMF5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Grik4Q8BMF5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Grik4Q8BMF5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Grik4Q8BMF5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Grik4Q8BMF5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Grik4Q8BMF5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Grik4Q8BMF5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Grik4Q8BMF5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Grik4Q8BMF5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Grik4Q8BMF5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Grik4Q8BMF5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Grik4Q8BMF5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Grik4Q8BMF5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Grik4Q8BMF5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Grik4Q8BMF5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Grik4Q8BMF5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms