Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Tnrc6bQ8BKI2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Tnrc6bQ8BKI2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Tnrc6bQ8BKI2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Tnrc6bQ8BKI2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tnrc6bQ8BKI2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tnrc6bQ8BKI2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tnrc6bQ8BKI2 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tnrc6bQ8BKI2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tnrc6bQ8BKI2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tnrc6bQ8BKI2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Tnrc6bQ8BKI2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tnrc6bQ8BKI2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Tnrc6bQ8BKI2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tnrc6bQ8BKI2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tnrc6bQ8BKI2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tnrc6bQ8BKI2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tnrc6bQ8BKI2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tnrc6bQ8BKI2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tnrc6bQ8BKI2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tnrc6bQ8BKI2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Tnrc6bQ8BKI2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Tnrc6bQ8BKI2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
Tnrc6bQ8BKI2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Tnrc6bQ8BKI2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Tnrc6bQ8BKI2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Tnrc6bQ8BKI2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tnrc6bQ8BKI2 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tnrc6bQ8BKI2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Tnrc6bQ8BKI2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tnrc6bQ8BKI2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Tnrc6bQ8BKI2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tnrc6bQ8BKI2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
Tnrc6bQ8BKI2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Tnrc6bQ8BKI2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tnrc6bQ8BKI2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tnrc6bQ8BKI2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tnrc6bQ8BKI2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tnrc6bQ8BKI2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Tnrc6bQ8BKI2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tnrc6bQ8BKI2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tnrc6bQ8BKI2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tnrc6bQ8BKI2 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tnrc6bQ8BKI2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tnrc6bQ8BKI2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tnrc6bQ8BKI2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tnrc6bQ8BKI2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tnrc6bQ8BKI2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Tnrc6bQ8BKI2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tnrc6bQ8BKI2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tnrc6bQ8BKI2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tnrc6bQ8BKI2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
Tnrc6bQ8BKI2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Tnrc6bQ8BKI2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
Tnrc6bQ8BKI2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC29.64■■■□□ 2.33
Tnrc6bQ8BKI2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tnrc6bQ8BKI2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tnrc6bQ8BKI2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
Tnrc6bQ8BKI2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tnrc6bQ8BKI2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
Tnrc6bQ8BKI2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tnrc6bQ8BKI2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Tnrc6bQ8BKI2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tnrc6bQ8BKI2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tnrc6bQ8BKI2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tnrc6bQ8BKI2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tnrc6bQ8BKI2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tnrc6bQ8BKI2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tnrc6bQ8BKI2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Tnrc6bQ8BKI2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tnrc6bQ8BKI2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Tnrc6bQ8BKI2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tnrc6bQ8BKI2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tnrc6bQ8BKI2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tnrc6bQ8BKI2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Tnrc6bQ8BKI2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
Tnrc6bQ8BKI2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
Tnrc6bQ8BKI2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tnrc6bQ8BKI2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tnrc6bQ8BKI2 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tnrc6bQ8BKI2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tnrc6bQ8BKI2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tnrc6bQ8BKI2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Tnrc6bQ8BKI2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tnrc6bQ8BKI2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tnrc6bQ8BKI2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Tnrc6bQ8BKI2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tnrc6bQ8BKI2 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tnrc6bQ8BKI2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Tnrc6bQ8BKI2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms