Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH60

Gopc, Golgi-associated PDZ and coiled-coil motif-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GopcQ8BH60 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GopcQ8BH60 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GopcQ8BH60 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GopcQ8BH60 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GopcQ8BH60 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GopcQ8BH60 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GopcQ8BH60 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GopcQ8BH60 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GopcQ8BH60 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GopcQ8BH60 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GopcQ8BH60 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GopcQ8BH60 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GopcQ8BH60 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GopcQ8BH60 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GopcQ8BH60 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GopcQ8BH60 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GopcQ8BH60 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GopcQ8BH60 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GopcQ8BH60 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GopcQ8BH60 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GopcQ8BH60 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GopcQ8BH60 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GopcQ8BH60 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GopcQ8BH60 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GopcQ8BH60 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GopcQ8BH60 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GopcQ8BH60 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GopcQ8BH60 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GopcQ8BH60 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GopcQ8BH60 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GopcQ8BH60 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GopcQ8BH60 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GopcQ8BH60 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GopcQ8BH60 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GopcQ8BH60 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GopcQ8BH60 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GopcQ8BH60 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GopcQ8BH60 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GopcQ8BH60 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GopcQ8BH60 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GopcQ8BH60 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GopcQ8BH60 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GopcQ8BH60 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GopcQ8BH60 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GopcQ8BH60 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GopcQ8BH60 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GopcQ8BH60 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GopcQ8BH60 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GopcQ8BH60 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GopcQ8BH60 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GopcQ8BH60 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GopcQ8BH60 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GopcQ8BH60 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GopcQ8BH60 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GopcQ8BH60 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GopcQ8BH60 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms