Protein–RNA interactions for Protein: Q8BFY9

Tnpo1, Transportin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnpo1Q8BFY9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnpo1Q8BFY9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnpo1Q8BFY9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnpo1Q8BFY9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnpo1Q8BFY9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnpo1Q8BFY9 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tnpo1Q8BFY9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnpo1Q8BFY9 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnpo1Q8BFY9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnpo1Q8BFY9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnpo1Q8BFY9 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnpo1Q8BFY9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnpo1Q8BFY9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnpo1Q8BFY9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnpo1Q8BFY9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tnpo1Q8BFY9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tnpo1Q8BFY9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tnpo1Q8BFY9 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tnpo1Q8BFY9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Tnpo1Q8BFY9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tnpo1Q8BFY9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tnpo1Q8BFY9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tnpo1Q8BFY9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tnpo1Q8BFY9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Tnpo1Q8BFY9 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tnpo1Q8BFY9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Tnpo1Q8BFY9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tnpo1Q8BFY9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tnpo1Q8BFY9 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tnpo1Q8BFY9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tnpo1Q8BFY9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tnpo1Q8BFY9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tnpo1Q8BFY9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tnpo1Q8BFY9 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tnpo1Q8BFY9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Tnpo1Q8BFY9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Tnpo1Q8BFY9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnpo1Q8BFY9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnpo1Q8BFY9 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnpo1Q8BFY9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnpo1Q8BFY9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnpo1Q8BFY9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnpo1Q8BFY9 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tnpo1Q8BFY9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnpo1Q8BFY9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnpo1Q8BFY9 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnpo1Q8BFY9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tnpo1Q8BFY9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnpo1Q8BFY9 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnpo1Q8BFY9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tnpo1Q8BFY9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnpo1Q8BFY9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnpo1Q8BFY9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnpo1Q8BFY9 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tnpo1Q8BFY9 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnpo1Q8BFY9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnpo1Q8BFY9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tnpo1Q8BFY9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Tnpo1Q8BFY9 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tnpo1Q8BFY9 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnpo1Q8BFY9 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnpo1Q8BFY9 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnpo1Q8BFY9 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnpo1Q8BFY9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tnpo1Q8BFY9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tnpo1Q8BFY9 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tnpo1Q8BFY9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tnpo1Q8BFY9 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tnpo1Q8BFY9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Tnpo1Q8BFY9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tnpo1Q8BFY9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tnpo1Q8BFY9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tnpo1Q8BFY9 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tnpo1Q8BFY9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tnpo1Q8BFY9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tnpo1Q8BFY9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tnpo1Q8BFY9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnpo1Q8BFY9 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnpo1Q8BFY9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnpo1Q8BFY9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnpo1Q8BFY9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnpo1Q8BFY9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tnpo1Q8BFY9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
Tnpo1Q8BFY9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnpo1Q8BFY9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnpo1Q8BFY9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnpo1Q8BFY9 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnpo1Q8BFY9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnpo1Q8BFY9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnpo1Q8BFY9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnpo1Q8BFY9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnpo1Q8BFY9 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnpo1Q8BFY9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Tnpo1Q8BFY9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnpo1Q8BFY9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnpo1Q8BFY9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Tnpo1Q8BFY9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Tnpo1Q8BFY9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnpo1Q8BFY9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tnpo1Q8BFY9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms