Protein–RNA interactions for Protein: Q86UR5

RIMS1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,692 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS1Q86UR5 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
RIMS1Q86UR5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
RIMS1Q86UR5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.37
RIMS1Q86UR5 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
RIMS1Q86UR5 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
RIMS1Q86UR5 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
RIMS1Q86UR5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
RIMS1Q86UR5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
RIMS1Q86UR5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RIMS1Q86UR5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
RIMS1Q86UR5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
RIMS1Q86UR5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
RIMS1Q86UR5 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RIMS1Q86UR5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC36.03■■■■□ 3.36
RIMS1Q86UR5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RIMS1Q86UR5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RIMS1Q86UR5 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
RIMS1Q86UR5 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
RIMS1Q86UR5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
RIMS1Q86UR5 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
RIMS1Q86UR5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
RIMS1Q86UR5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
RIMS1Q86UR5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
RIMS1Q86UR5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36■■■■□ 3.35
RIMS1Q86UR5 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
RIMS1Q86UR5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
RIMS1Q86UR5 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
RIMS1Q86UR5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
RIMS1Q86UR5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
RIMS1Q86UR5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RIMS1Q86UR5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RIMS1Q86UR5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
RIMS1Q86UR5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
RIMS1Q86UR5 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
RIMS1Q86UR5 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
RIMS1Q86UR5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
RIMS1Q86UR5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
RIMS1Q86UR5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC35.95■■■■□ 3.35
RIMS1Q86UR5 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
RIMS1Q86UR5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
RIMS1Q86UR5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
RIMS1Q86UR5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC35.93■■■■□ 3.34
RIMS1Q86UR5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
RIMS1Q86UR5 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RIMS1Q86UR5 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RIMS1Q86UR5 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
RIMS1Q86UR5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
RIMS1Q86UR5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
RIMS1Q86UR5 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
RIMS1Q86UR5 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC35.91■■■■□ 3.34
RIMS1Q86UR5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
RIMS1Q86UR5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
RIMS1Q86UR5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
RIMS1Q86UR5 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
RIMS1Q86UR5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
RIMS1Q86UR5 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
RIMS1Q86UR5 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
RIMS1Q86UR5 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
RIMS1Q86UR5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
RIMS1Q86UR5 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
RIMS1Q86UR5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
RIMS1Q86UR5 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC35.88■■■■□ 3.33
RIMS1Q86UR5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
RIMS1Q86UR5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
RIMS1Q86UR5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
RIMS1Q86UR5 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC35.88■■■■□ 3.33
RIMS1Q86UR5 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
RIMS1Q86UR5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
RIMS1Q86UR5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC35.85■■■■□ 3.33
RIMS1Q86UR5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
RIMS1Q86UR5 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
RIMS1Q86UR5 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC35.84■■■■□ 3.33
RIMS1Q86UR5 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
RIMS1Q86UR5 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
RIMS1Q86UR5 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC35.84■■■■□ 3.33
RIMS1Q86UR5 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
RIMS1Q86UR5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
RIMS1Q86UR5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
RIMS1Q86UR5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
RIMS1Q86UR5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
RIMS1Q86UR5 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
RIMS1Q86UR5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
RIMS1Q86UR5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
RIMS1Q86UR5 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RIMS1Q86UR5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
RIMS1Q86UR5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
RIMS1Q86UR5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RIMS1Q86UR5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
RIMS1Q86UR5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
RIMS1Q86UR5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC35.81■■■■□ 3.32
RIMS1Q86UR5 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
RIMS1Q86UR5 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
RIMS1Q86UR5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
RIMS1Q86UR5 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC35.79■■■■□ 3.32
RIMS1Q86UR5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RIMS1Q86UR5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RIMS1Q86UR5 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RIMS1Q86UR5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
RIMS1Q86UR5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.78■■■■□ 3.32
RIMS1Q86UR5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms