Protein–RNA interactions for Protein: Q811C2

Atg4c, Cysteine protease ATG4C, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4cQ811C2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atg4cQ811C2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atg4cQ811C2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atg4cQ811C2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Atg4cQ811C2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Atg4cQ811C2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atg4cQ811C2 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Atg4cQ811C2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Atg4cQ811C2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Atg4cQ811C2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg4cQ811C2 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg4cQ811C2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg4cQ811C2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg4cQ811C2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg4cQ811C2 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg4cQ811C2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Atg4cQ811C2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg4cQ811C2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg4cQ811C2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg4cQ811C2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg4cQ811C2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg4cQ811C2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg4cQ811C2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg4cQ811C2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg4cQ811C2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg4cQ811C2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg4cQ811C2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg4cQ811C2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Atg4cQ811C2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg4cQ811C2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg4cQ811C2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg4cQ811C2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg4cQ811C2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg4cQ811C2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Atg4cQ811C2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg4cQ811C2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg4cQ811C2 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg4cQ811C2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Atg4cQ811C2 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg4cQ811C2 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg4cQ811C2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg4cQ811C2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg4cQ811C2 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Atg4cQ811C2 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Atg4cQ811C2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Atg4cQ811C2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Atg4cQ811C2 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Atg4cQ811C2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Atg4cQ811C2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Atg4cQ811C2 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg4cQ811C2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg4cQ811C2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Atg4cQ811C2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg4cQ811C2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg4cQ811C2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg4cQ811C2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg4cQ811C2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Atg4cQ811C2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg4cQ811C2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg4cQ811C2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Atg4cQ811C2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atg4cQ811C2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atg4cQ811C2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Atg4cQ811C2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atg4cQ811C2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Atg4cQ811C2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atg4cQ811C2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atg4cQ811C2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Atg4cQ811C2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atg4cQ811C2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atg4cQ811C2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Atg4cQ811C2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atg4cQ811C2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Atg4cQ811C2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg4cQ811C2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg4cQ811C2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg4cQ811C2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg4cQ811C2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg4cQ811C2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg4cQ811C2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg4cQ811C2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg4cQ811C2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Atg4cQ811C2 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg4cQ811C2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg4cQ811C2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Atg4cQ811C2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg4cQ811C2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg4cQ811C2 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg4cQ811C2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Atg4cQ811C2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg4cQ811C2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg4cQ811C2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg4cQ811C2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg4cQ811C2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg4cQ811C2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg4cQ811C2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Atg4cQ811C2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg4cQ811C2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg4cQ811C2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Atg4cQ811C2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms