Protein–RNA interactions for Protein: Q810U5

Ccdc50, Coiled-coil domain-containing protein 50, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc50Q810U5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ccdc50Q810U5 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc50Q810U5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc50Q810U5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc50Q810U5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc50Q810U5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc50Q810U5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc50Q810U5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ccdc50Q810U5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc50Q810U5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc50Q810U5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc50Q810U5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc50Q810U5 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ccdc50Q810U5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc50Q810U5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc50Q810U5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc50Q810U5 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc50Q810U5 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc50Q810U5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ccdc50Q810U5 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc50Q810U5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc50Q810U5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc50Q810U5 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc50Q810U5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc50Q810U5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc50Q810U5 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc50Q810U5 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc50Q810U5 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc50Q810U5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc50Q810U5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc50Q810U5 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc50Q810U5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc50Q810U5 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc50Q810U5 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc50Q810U5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc50Q810U5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc50Q810U5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc50Q810U5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc50Q810U5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc50Q810U5 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc50Q810U5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc50Q810U5 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc50Q810U5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc50Q810U5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc50Q810U5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc50Q810U5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc50Q810U5 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc50Q810U5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc50Q810U5 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc50Q810U5 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc50Q810U5 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc50Q810U5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ccdc50Q810U5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc50Q810U5 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc50Q810U5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc50Q810U5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ccdc50Q810U5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms