Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tmem39bQ810L4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmem39bQ810L4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmem39bQ810L4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmem39bQ810L4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmem39bQ810L4 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tmem39bQ810L4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmem39bQ810L4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmem39bQ810L4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmem39bQ810L4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmem39bQ810L4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmem39bQ810L4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tmem39bQ810L4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmem39bQ810L4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmem39bQ810L4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmem39bQ810L4 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmem39bQ810L4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tmem39bQ810L4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem39bQ810L4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem39bQ810L4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tmem39bQ810L4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem39bQ810L4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem39bQ810L4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem39bQ810L4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem39bQ810L4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem39bQ810L4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem39bQ810L4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem39bQ810L4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tmem39bQ810L4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem39bQ810L4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem39bQ810L4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem39bQ810L4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem39bQ810L4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem39bQ810L4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem39bQ810L4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tmem39bQ810L4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tmem39bQ810L4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmem39bQ810L4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmem39bQ810L4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmem39bQ810L4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmem39bQ810L4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tmem39bQ810L4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem39bQ810L4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem39bQ810L4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem39bQ810L4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem39bQ810L4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem39bQ810L4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tmem39bQ810L4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmem39bQ810L4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmem39bQ810L4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmem39bQ810L4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmem39bQ810L4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tmem39bQ810L4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmem39bQ810L4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmem39bQ810L4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmem39bQ810L4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tmem39bQ810L4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmem39bQ810L4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmem39bQ810L4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmem39bQ810L4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Tmem39bQ810L4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms