Protein–RNA interactions for Protein: Q80VJ8

Ccdc155, Protein KASH5, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc155Q80VJ8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc155Q80VJ8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc155Q80VJ8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc155Q80VJ8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc155Q80VJ8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Ccdc155Q80VJ8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc155Q80VJ8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc155Q80VJ8 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc155Q80VJ8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc155Q80VJ8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Ccdc155Q80VJ8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc155Q80VJ8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc155Q80VJ8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc155Q80VJ8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc155Q80VJ8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc155Q80VJ8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc155Q80VJ8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc155Q80VJ8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc155Q80VJ8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc155Q80VJ8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc155Q80VJ8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc155Q80VJ8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc155Q80VJ8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc155Q80VJ8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc155Q80VJ8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc155Q80VJ8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc155Q80VJ8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc155Q80VJ8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc155Q80VJ8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc155Q80VJ8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc155Q80VJ8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Ccdc155Q80VJ8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc155Q80VJ8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Ccdc155Q80VJ8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc155Q80VJ8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc155Q80VJ8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc155Q80VJ8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc155Q80VJ8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc155Q80VJ8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc155Q80VJ8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc155Q80VJ8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc155Q80VJ8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc155Q80VJ8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc155Q80VJ8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc155Q80VJ8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc155Q80VJ8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc155Q80VJ8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc155Q80VJ8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc155Q80VJ8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc155Q80VJ8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc155Q80VJ8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc155Q80VJ8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc155Q80VJ8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc155Q80VJ8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc155Q80VJ8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc155Q80VJ8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc155Q80VJ8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc155Q80VJ8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc155Q80VJ8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc155Q80VJ8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc155Q80VJ8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ccdc155Q80VJ8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc155Q80VJ8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc155Q80VJ8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc155Q80VJ8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ccdc155Q80VJ8 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc155Q80VJ8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc155Q80VJ8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc155Q80VJ8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ccdc155Q80VJ8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc155Q80VJ8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc155Q80VJ8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc155Q80VJ8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc155Q80VJ8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc155Q80VJ8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ccdc155Q80VJ8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc155Q80VJ8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc155Q80VJ8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc155Q80VJ8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc155Q80VJ8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Ccdc155Q80VJ8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc155Q80VJ8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc155Q80VJ8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Ccdc155Q80VJ8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc155Q80VJ8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Ccdc155Q80VJ8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc155Q80VJ8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc155Q80VJ8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc155Q80VJ8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc155Q80VJ8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc155Q80VJ8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc155Q80VJ8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc155Q80VJ8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc155Q80VJ8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc155Q80VJ8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Ccdc155Q80VJ8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc155Q80VJ8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc155Q80VJ8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc155Q80VJ8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc155Q80VJ8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms