Protein–RNA interactions for Protein: Q80UQ2

Rassf6, Ras association domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rassf6Q80UQ2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rassf6Q80UQ2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rassf6Q80UQ2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rassf6Q80UQ2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rassf6Q80UQ2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rassf6Q80UQ2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rassf6Q80UQ2 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rassf6Q80UQ2 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rassf6Q80UQ2 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rassf6Q80UQ2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rassf6Q80UQ2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rassf6Q80UQ2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rassf6Q80UQ2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rassf6Q80UQ2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rassf6Q80UQ2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rassf6Q80UQ2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rassf6Q80UQ2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rassf6Q80UQ2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rassf6Q80UQ2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rassf6Q80UQ2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rassf6Q80UQ2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rassf6Q80UQ2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rassf6Q80UQ2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rassf6Q80UQ2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rassf6Q80UQ2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rassf6Q80UQ2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rassf6Q80UQ2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rassf6Q80UQ2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rassf6Q80UQ2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rassf6Q80UQ2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Rassf6Q80UQ2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rassf6Q80UQ2 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rassf6Q80UQ2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rassf6Q80UQ2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rassf6Q80UQ2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rassf6Q80UQ2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rassf6Q80UQ2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rassf6Q80UQ2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rassf6Q80UQ2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rassf6Q80UQ2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rassf6Q80UQ2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rassf6Q80UQ2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rassf6Q80UQ2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rassf6Q80UQ2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rassf6Q80UQ2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rassf6Q80UQ2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rassf6Q80UQ2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rassf6Q80UQ2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rassf6Q80UQ2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rassf6Q80UQ2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rassf6Q80UQ2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rassf6Q80UQ2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Rassf6Q80UQ2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rassf6Q80UQ2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rassf6Q80UQ2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rassf6Q80UQ2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rassf6Q80UQ2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rassf6Q80UQ2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms