Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Otop3Q80UF9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Otop3Q80UF9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Otop3Q80UF9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Otop3Q80UF9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Otop3Q80UF9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Otop3Q80UF9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Otop3Q80UF9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Otop3Q80UF9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Otop3Q80UF9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Otop3Q80UF9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Otop3Q80UF9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Otop3Q80UF9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Otop3Q80UF9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Otop3Q80UF9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Otop3Q80UF9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Otop3Q80UF9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Otop3Q80UF9 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Otop3Q80UF9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Otop3Q80UF9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Otop3Q80UF9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Otop3Q80UF9 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Otop3Q80UF9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Otop3Q80UF9 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Otop3Q80UF9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Otop3Q80UF9 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Otop3Q80UF9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Otop3Q80UF9 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Otop3Q80UF9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Otop3Q80UF9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Otop3Q80UF9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Otop3Q80UF9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Otop3Q80UF9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Otop3Q80UF9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Otop3Q80UF9 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Otop3Q80UF9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Otop3Q80UF9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Otop3Q80UF9 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Otop3Q80UF9 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Otop3Q80UF9 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Otop3Q80UF9 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Otop3Q80UF9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Otop3Q80UF9 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Otop3Q80UF9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Otop3Q80UF9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Otop3Q80UF9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Otop3Q80UF9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Otop3Q80UF9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Otop3Q80UF9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Otop3Q80UF9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Otop3Q80UF9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Otop3Q80UF9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Otop3Q80UF9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Otop3Q80UF9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Otop3Q80UF9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Otop3Q80UF9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Otop3Q80UF9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Otop3Q80UF9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Otop3Q80UF9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Otop3Q80UF9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Otop3Q80UF9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Otop3Q80UF9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Otop3Q80UF9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Otop3Q80UF9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Otop3Q80UF9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Otop3Q80UF9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Otop3Q80UF9 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Otop3Q80UF9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Otop3Q80UF9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Otop3Q80UF9 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Otop3Q80UF9 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Otop3Q80UF9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Otop3Q80UF9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Otop3Q80UF9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Otop3Q80UF9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Otop3Q80UF9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Otop3Q80UF9 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Otop3Q80UF9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Otop3Q80UF9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Otop3Q80UF9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Otop3Q80UF9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Otop3Q80UF9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Otop3Q80UF9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Otop3Q80UF9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Otop3Q80UF9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Otop3Q80UF9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Otop3Q80UF9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Otop3Q80UF9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Otop3Q80UF9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Otop3Q80UF9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Otop3Q80UF9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Otop3Q80UF9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Otop3Q80UF9 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Otop3Q80UF9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Otop3Q80UF9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Otop3Q80UF9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Otop3Q80UF9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Otop3Q80UF9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Otop3Q80UF9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Otop3Q80UF9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms