Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z422

SZRD1, SUZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1Q7Z422 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SZRD1Q7Z422 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SZRD1Q7Z422 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SZRD1Q7Z422 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SZRD1Q7Z422 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SZRD1Q7Z422 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SZRD1Q7Z422 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SZRD1Q7Z422 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SZRD1Q7Z422 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SZRD1Q7Z422 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SZRD1Q7Z422 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SZRD1Q7Z422 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SZRD1Q7Z422 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SZRD1Q7Z422 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SZRD1Q7Z422 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SZRD1Q7Z422 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SZRD1Q7Z422 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SZRD1Q7Z422 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SZRD1Q7Z422 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SZRD1Q7Z422 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SZRD1Q7Z422 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SZRD1Q7Z422 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SZRD1Q7Z422 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SZRD1Q7Z422 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SZRD1Q7Z422 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SZRD1Q7Z422 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SZRD1Q7Z422 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SZRD1Q7Z422 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SZRD1Q7Z422 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SZRD1Q7Z422 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SZRD1Q7Z422 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SZRD1Q7Z422 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SZRD1Q7Z422 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SZRD1Q7Z422 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SZRD1Q7Z422 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SZRD1Q7Z422 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SZRD1Q7Z422 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SZRD1Q7Z422 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SZRD1Q7Z422 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SZRD1Q7Z422 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SZRD1Q7Z422 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SZRD1Q7Z422 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SZRD1Q7Z422 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SZRD1Q7Z422 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SZRD1Q7Z422 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SZRD1Q7Z422 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SZRD1Q7Z422 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SZRD1Q7Z422 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
SZRD1Q7Z422 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SZRD1Q7Z422 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SZRD1Q7Z422 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SZRD1Q7Z422 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SZRD1Q7Z422 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SZRD1Q7Z422 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SZRD1Q7Z422 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SZRD1Q7Z422 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SZRD1Q7Z422 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SZRD1Q7Z422 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SZRD1Q7Z422 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms