Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS74

Ckap2l, Cytoskeleton-associated protein 2-like, mousemouse

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ckap2lQ7TS74 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ckap2lQ7TS74 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ckap2lQ7TS74 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ckap2lQ7TS74 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ckap2lQ7TS74 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ckap2lQ7TS74 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ckap2lQ7TS74 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ckap2lQ7TS74 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ckap2lQ7TS74 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ckap2lQ7TS74 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ckap2lQ7TS74 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ckap2lQ7TS74 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ckap2lQ7TS74 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ckap2lQ7TS74 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ckap2lQ7TS74 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ckap2lQ7TS74 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ckap2lQ7TS74 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ckap2lQ7TS74 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ckap2lQ7TS74 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ckap2lQ7TS74 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ckap2lQ7TS74 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ckap2lQ7TS74 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ckap2lQ7TS74 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ckap2lQ7TS74 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms