Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Zfp397Q7TNK4 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zfp397Q7TNK4 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zfp397Q7TNK4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zfp397Q7TNK4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Zfp397Q7TNK4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zfp397Q7TNK4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zfp397Q7TNK4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zfp397Q7TNK4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Zfp397Q7TNK4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zfp397Q7TNK4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zfp397Q7TNK4 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zfp397Q7TNK4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zfp397Q7TNK4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Zfp397Q7TNK4 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfp397Q7TNK4 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfp397Q7TNK4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfp397Q7TNK4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Zfp397Q7TNK4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zfp397Q7TNK4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zfp397Q7TNK4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zfp397Q7TNK4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Zfp397Q7TNK4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zfp397Q7TNK4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Zfp397Q7TNK4 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Zfp397Q7TNK4 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zfp397Q7TNK4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zfp397Q7TNK4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Zfp397Q7TNK4 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Zfp397Q7TNK4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp397Q7TNK4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp397Q7TNK4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp397Q7TNK4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp397Q7TNK4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp397Q7TNK4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp397Q7TNK4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Zfp397Q7TNK4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfp397Q7TNK4 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfp397Q7TNK4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfp397Q7TNK4 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Zfp397Q7TNK4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp397Q7TNK4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp397Q7TNK4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp397Q7TNK4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp397Q7TNK4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp397Q7TNK4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp397Q7TNK4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp397Q7TNK4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp397Q7TNK4 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Zfp397Q7TNK4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp397Q7TNK4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp397Q7TNK4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Zfp397Q7TNK4 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp397Q7TNK4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp397Q7TNK4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp397Q7TNK4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp397Q7TNK4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Zfp397Q7TNK4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.9 ms