Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HS2ST1Q7LGA3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HS2ST1Q7LGA3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HS2ST1Q7LGA3 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
HS2ST1Q7LGA3 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HS2ST1Q7LGA3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HS2ST1Q7LGA3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HS2ST1Q7LGA3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HS2ST1Q7LGA3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HS2ST1Q7LGA3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HS2ST1Q7LGA3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HS2ST1Q7LGA3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HS2ST1Q7LGA3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HS2ST1Q7LGA3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HS2ST1Q7LGA3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
HS2ST1Q7LGA3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HS2ST1Q7LGA3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HS2ST1Q7LGA3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HS2ST1Q7LGA3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HS2ST1Q7LGA3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HS2ST1Q7LGA3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HS2ST1Q7LGA3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HS2ST1Q7LGA3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HS2ST1Q7LGA3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HS2ST1Q7LGA3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HS2ST1Q7LGA3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HS2ST1Q7LGA3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HS2ST1Q7LGA3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HS2ST1Q7LGA3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HS2ST1Q7LGA3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HS2ST1Q7LGA3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HS2ST1Q7LGA3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HS2ST1Q7LGA3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HS2ST1Q7LGA3 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HS2ST1Q7LGA3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HS2ST1Q7LGA3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HS2ST1Q7LGA3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HS2ST1Q7LGA3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HS2ST1Q7LGA3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HS2ST1Q7LGA3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HS2ST1Q7LGA3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HS2ST1Q7LGA3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HS2ST1Q7LGA3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
HS2ST1Q7LGA3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HS2ST1Q7LGA3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HS2ST1Q7LGA3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HS2ST1Q7LGA3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HS2ST1Q7LGA3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HS2ST1Q7LGA3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HS2ST1Q7LGA3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HS2ST1Q7LGA3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HS2ST1Q7LGA3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HS2ST1Q7LGA3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HS2ST1Q7LGA3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HS2ST1Q7LGA3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HS2ST1Q7LGA3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HS2ST1Q7LGA3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HS2ST1Q7LGA3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HS2ST1Q7LGA3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HS2ST1Q7LGA3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HS2ST1Q7LGA3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
HS2ST1Q7LGA3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HS2ST1Q7LGA3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HS2ST1Q7LGA3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HS2ST1Q7LGA3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HS2ST1Q7LGA3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HS2ST1Q7LGA3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HS2ST1Q7LGA3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HS2ST1Q7LGA3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HS2ST1Q7LGA3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HS2ST1Q7LGA3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HS2ST1Q7LGA3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HS2ST1Q7LGA3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HS2ST1Q7LGA3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HS2ST1Q7LGA3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HS2ST1Q7LGA3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HS2ST1Q7LGA3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HS2ST1Q7LGA3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HS2ST1Q7LGA3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HS2ST1Q7LGA3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HS2ST1Q7LGA3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HS2ST1Q7LGA3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HS2ST1Q7LGA3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HS2ST1Q7LGA3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
HS2ST1Q7LGA3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HS2ST1Q7LGA3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HS2ST1Q7LGA3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HS2ST1Q7LGA3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HS2ST1Q7LGA3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HS2ST1Q7LGA3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HS2ST1Q7LGA3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HS2ST1Q7LGA3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HS2ST1Q7LGA3 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HS2ST1Q7LGA3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HS2ST1Q7LGA3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HS2ST1Q7LGA3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HS2ST1Q7LGA3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HS2ST1Q7LGA3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HS2ST1Q7LGA3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HS2ST1Q7LGA3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms